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一、混合开发的优势
1、混合开发的优势在于开发时间短，能节省APP制作的工期、人员费用上的支出，客户能更快的接收到交付的程序。省时省力节约运营成本。
2、混合开发还有很强的关联性，在跨平台应用方面有不错的表现，包括但不限于pc端、小程序端、APP端等，可以同时APP端、微信小程序端和手机网页端运营。
3、混合开发的难度较小，在选择混合开发时，可以支持各类型的功能定制开发，个性化打造，更为灵活广泛的应用，程序员也相对更多，维护起来更为简单。
二、原生开发的劣势
1、开发成本高且周期长，费用会高很多，安卓苹果分为两个不同的代码，开发成本高出一到两倍，想对的开发周期也更为漫长，对绝大多数初创运营者来说非常的不友好。
2、维护成本高，原生开发更像一次性开发，平台的合作像是和开发团队签了终生协议一样，对外人来说可能一时间无法对当前架构进行改变。也就是说一般人改不了，可操作性不强。
总结：用JAVA和PHP开发只是两种开发语言架构方式的不同，伴随着互联网时代的发展和完善，混合开发也能够达到原生开发的效果，且省时省力。对初创的运营者更为友好，前期不需要投入过大的成本，就能实现想要的功能，上线后看运营效果还可以个性化开发。且技术员好招，人工成本就低很多了，如果开发预算足够多可以选择原生开发。